CODESYS adresinin ve belirli düzenleyicilerin davranışını etkileyen ayarları «Proje Ayarları» nesnesinde yapılandırabilirsiniz. Ayarlar proje boyunca geçerlidir ve aktif editörler için hemen uygulanır. Nesnenin iletişim kutularına erişmek için «Project  Project Settings» komutunu da kullanabilirsiniz.

CODESYS Proje ayarlarını proje içinde bir nesne olarak kaydeder. Daha sonra bir projeyi başka bir sisteme aktardığınızda, «Project Settings» nesnesi de onunla birlikte aktarılır. Proje arşivine gerek yoktur.